Publications of K. Ayyer

U. J. Lorenz, R. I. Enchev, C. F. Megarity, H. Ginn, P. Rabe, A. R. Walker, and K. Ayyer, Introducing: Ulrich J. Lorenz, Radoslav I. Enchev, Clare F. Megarity, Helen Ginn, Patrick Rabe, Alice R. Walker, and Kartik Ayyer, Structure 32 (5), 511–516 (2024).

T. Wollweber and K. Ayyer, Nanoscale x-ray imaging with high spectral sensitivity using fluorescence intensity correlations, Structural Dynamics 11 (2), 024307 (2024).

T. Ekeberg, D. Assalauova, J. Bielecki, R. Boll, B. J. Daurer, L. A. Eichacker, L. E. Franken, D. E. Galli, L. Gelisio, L. Gumprecht, L. H. Gunn, J. Hajdu, R. Hartmann, D. Hasse, A. Ignatenko, J. Koliyadu, O. Kulyk, R. Kurta, M. Kuster, W. Lugmayr, J. Lübke, A. P. Mancuso, T. Mazza, C. Nettelblad, Y. Ovcharenko, D. E. Rivas, M. Rose, A. K. Samanta, P. Schmidt, E. Sobolev, N. Timneanu, S. Usenko, D. Westphal, T. Wollweber, L. Worbs, P. L. Xavier, H. Yousef, K. Ayyer, H. N. Chapman, J. A. Sellberg, C. Seuring, I. A. Vartanyants, J. Küpper, M. Meyer, and F. R. N. C. Maia, Observation of a single protein by ultrafast X-ray diffraction, Light: Science & Applications 13, 15 (2024).

N. Roth, D. A. Horke, J. Lübke, A. K. Samanta, A. D. Estillore, L. Worbs, N. Pohlman, K. Ayyer, A. Morgan, H. Fleckenstein, M. Domaracky, B. Erk, C. Passow, J. Correa, O. Yefanov, A. Barty, S. Bajt, R. A. Kirian, H. N. Chapman, and J. Küpper, New aerodynamic lens injector for single particle diffractive imaging, Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A: Accelerators, Spectrometers, Detectors and Associated Equipment 1058, 168820 (2024).

C. E. Blanchet, A. Round, H. D. T. Mertens, K. Ayyer, M. Graewert, S. Awel, D. Franke, K. Dörner, S. Bajt, R. Bean, T. F. Custódio, R. de Wijn, E. Juncheng, A. Henkel, A. Gruzinov, C. M. Jeffries, Y. Kim, H. Kirkwood, M. Kloos, J. Knoška, J. Koliyadu, R. Letrun, C. Löw, J. Makroczyova, A. Mall, R. Meijers, G. E. P. Murillo, D. Oberthür, E. Round, C. Seuring, M. Sikorski, P. Vagovic, J. Valerio, T. Wollweber, Y. Zhuang, J. Schulz, H. Haas, H. N. Chapman, A. P. Mancuso, and D. Svergun, Form factor determination of biological molecules with X-ray free electron laser small-angle scattering (XFEL-SAS), Communications Biology 6, 1057 (2023).

N. Peard, K. Ayyer, and H. N. Chapman, Ab initio spatial phase retrieval via intensity triple correlations, Optics Express 31 (15), 25082–25092 (2023).

D. Hoeing, R. Salzwedel, L. Worbs, Y. Zhuang, A. K. Samanta, J. Lübke, A. Estillore, K. Dlugolecki, C. Passow, B. Erk, N. Ekanayaje, D. Ramm, J. Correa, C. C. Papadooulou, A. T. Noor, F. Schulz, M. Selig, A. Knorr, K. Ayyer, J. Küpper, and H. Lange, Time-Resolved Single-Particle X-ray Scattering Reveals Electron-Density Gradients As Coherent Plasmonic-Nanoparticle-Oscillation Source, Nano Letters 23 (13), 5943–5950 (2023).

J. P. J. Chen, K. Pande, J. J. Donatelli, A. V. Martin, K. Ayyer, H. N. Chapman, R. Bean, K. E. Schmidt, and R. A. Kirian, Inter-Bragg crystallographic phase retrieval from shape transforms, stacking faults and substitutional disorder, Ultramicroscopy 249, 113728 (2023).

A. Mall and K. Ayyer, Holographic Single-Particle Imaging for Weakly Scattering, Heterogeneous Nanoscale Objects, Physical Review Applied 19 (5), 054027 (2023).

F. Trost, K. Ayyer, M. Prasciolu, H. Fleckenstein, M. Barthelmess, O. Yefanov, J. L. Dresselhaus, C. Li, S. Bajt, J. Carnis, T. Wollweber, A. Mall, Z. Shen, Y. Zhuang, S. Richter, S. Karl, S. Cardoch, K. K. Patra, J. Möller, A. Zozulya, R. Shayduk, W. Lu, F. Brauße, B. Friedrich, U. Boesenberg, I. Petrov, S. Tomin, M. Guetg, A. Madsen, N. Timneanu, C. Caleman, R. Röhlsberger, J. von Zanthier, and H. N. Chapman, Imaging via Correlation of X-Ray Fluorescence Photons, Physical Review Letters 130 (17), 173201 (2023).

F. Trost, K. Ayyer, D. Oberthuer, O. Yefanov, S. Bajt, C. Caleman, A. Weimer, A. Feld, H. Weller, S. Boutet, J. Koglin, N. Timneanu, J. von Zanthier, R. Röhlsberger, and H. N. Chapman, Speckle contrast of interfering fluorescence X-rays, Journal of Synchrotron Radiation 30 (1), 11–23 (2023).

Y. Zhuang, S. Awel, A. Barty, R. Bean, J. Bielecki, M. Bergemann, B. J. Daurer, T. Ekeberg, A. D. Estillore, H. Fangohr, K. Giewekemeyer, M. S. Hunter, M. Karnevskiy, R. A. Kirian, H. Kirkwood, Y. Kim, J. Koliyadu, H. Lange, R. Letrun, J. Lübke, A. Mall, T. Michelat, A. J. Morgan, N. Roth, A. K. Samanta, T. Sato, Z. Shen, M. Sikorski, F. Schulz, J. C. H. Spence, P. Vagovic, T. Wollweber, L. Worbs, P. L. Xavier, O. Yefanov, F. R. N. C. Maia, D. A. Horke, J. Küpper, N. D. Loh, A. P. Mancuso, H. N. Chapman, and K. Ayyer, Unsupervised learning approaches to characterizing heterogeneous samples using X-ray single-particle imaging, IUCrJ 9 (2), 1–11 (2022).

Z. Shen, C. Z. W. Teo, K. Ayyer, and N. D. Loh, An encryption-decryption framework for validating single-particle imaging, Scientific Reports 11, 971 (2021).

K. Ayyer, P. L. Xavier, J. Bielecki, Z. Shen, B. J. Daurer, A. K. Samanta, S. Awel, R. Bean, A. Barty, T. Ekeberg, A. D. Estillore, H. Fangohr, K. Giewekemeyer, M. S. Hunter, M. Karnevskiy, R. A. Kirian, H. Kirkwood, Y. Kim, J. Koliyadu, H. Lange, R. Letrun, J. Lübke, T. Michelat, A. J. Morgan, N. Roth, T. Sato, M. Sikorski, F. Schulz, J. C. H. Spence, P. Vagovic, T. Wollweber, L. Worbs, O. Yefanov, Y. Zhuang, F. R. N. C. Maia, D. A. Horke, J. Küpper, N. D. Loh, A. P. Mancuso, and H. N. Chapman, 3D diffractive imaging of nanoparticle ensembles using an x-ray laser, Optica 8 (1), 15–23 (2021).

H. Li, R. Nazari, B. Abbey, R. Alvarez, A. Aquila, K. Ayyer, A. Barty, P. Berntsen, J. Bielecki, A. Pietrini, M. Bucher, G. Carini, H. N. Chapman, A. Contreras, B. J. Daurer, H. DeMirci, L. Flűckiger, M. Frank, J. Hajdu, M. F. Hantke, B. G. Hogue, A. Hosseinizadeh, M. S. Hunter, H. O. Jönsson, R. A. Kirian, R. P. Kurta, D. Loh, F. R. N. C. Maia, A. P. Mancuso, A. J. Morgan, M. McFadden, K. Muehlig, A. Munke, H. K. N. Reddy, C. Nettelblad, A. Ourmazd, M. Rose, P. Schwander, M. Marvin Seibert, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, Z. Sun, M. Svenda, I. A. Vartanyants, P. Walter, D. Westphal, G. Williams, P. L. Xavier, C. H. Yoon, and S. Zaare, Diffraction data from aerosolized Coliphage PR772 virus particles imaged with the Linac Coherent Light Source, Scientific Data 7, 404 (2020).

F. Trost, K. Ayyer, and H. N. Chapman, Photon statistics and signal to noise ratio for incoherent diffraction imaging, New Journal of Physics 22 (8), 083070 (2020).

E. Sobolev, S. Zolotarev, K. Giewekemeyer, J. Bielecki, K. Okamoto, H. K. N. Reddy, J. Andreasson, K. Ayyer, I. Barak, S. Bari, A. Barty, R. Bean, S. Bobkov, H. N. Chapman, G. Chojnowski, B. J. Daurer, K. Dörner, T. Ekeberg, L. Flückiger, O. Galzitskaya, L. Gelisio, S. Hauf, B. G. Hogue, D. A. Horke, A. Hosseinizadeh, V. Ilyin, C. Jung, C. Kim, Y. Kim, R. A. Kirian, H. Kirkwood, O. Kulyk, J. Küpper, R. Letrun, N. D. Loh, K. Lorenzen, M. Messerschmidt, K. Mühlig, A. Ourmazd, N. Raab, A. V. Rode, M. Rose, A. Round, T. Sato, R. Schubert, P. Schwander, J. A. Sellberg, M. Sikorski, A. Silenzi, C. Song, J. C. H. Spence, S. Stern, J. Sztuk-Dambietz, A. Teslyuk, N. Timneanu, M. Trebbin, C. Uetrecht, B. Weinhausen, G. J. Williams, P. L. Xavier, C. Xu, I. A. Vartanyants, V. S. Lamzin, A. Mancuso, and F. R. N. C. Maia, Megahertz single-particle imaging at the European XFEL, Communications Physics 3 (1), 97 (2020).

K. Ayyer, Reference-enhanced x-ray single-particle imaging, Optica 7 (6), 593–601 (2020).

K. Ayyer, A. J. Morgan, A. Aquila, H. DeMirci, B. G. Hogue, R. A. Kirian, L. X. Paulraj, C. H. Yoon, H. N. Chapman, and A. Barty, Low-signal limit of X-ray single particle diffractive imaging, Optics Express 27 (26), 37816–37833 (2019).

P. L. Xavier, K. Ayyer, O. Yefanov, L. Gelisio, J. Bielecki, A. K. Samanta, S. Bajt, R. Sha, D. A. Bushnell, R. D. Kornberg, Y. Ovcharenko, J. Kuepper, M. Meyer, N. C. Seeman, and H. N. Chapman, Femtosecond Single-Particle Diffractive Imaging of 3D DNA-Origami Molecular Scaffolds with XFEL Pulses, in Biophysical Journal, 2021, 3 Supplement 1. 120, , 265a .